Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BB287469Q3UT53 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BB287469Q3UT53 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BB287469Q3UT53 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BB287469Q3UT53 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BB287469Q3UT53 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BB287469Q3UT53 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BB287469Q3UT53 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BB287469Q3UT53 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BB287469Q3UT53 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BB287469Q3UT53 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BB287469Q3UT53 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BB287469Q3UT53 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BB287469Q3UT53 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BB287469Q3UT53 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BB287469Q3UT53 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BB287469Q3UT53 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BB287469Q3UT53 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BB287469Q3UT53 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BB287469Q3UT53 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BB287469Q3UT53 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BB287469Q3UT53 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BB287469Q3UT53 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BB287469Q3UT53 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BB287469Q3UT53 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BB287469Q3UT53 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BB287469Q3UT53 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BB287469Q3UT53 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BB287469Q3UT53 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BB287469Q3UT53 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BB287469Q3UT53 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BB287469Q3UT53 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BB287469Q3UT53 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BB287469Q3UT53 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BB287469Q3UT53 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BB287469Q3UT53 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BB287469Q3UT53 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BB287469Q3UT53 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BB287469Q3UT53 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BB287469Q3UT53 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BB287469Q3UT53 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms