Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQS8

Rbm20, RNA-binding protein 20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm20Q3UQS8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbm20Q3UQS8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms