Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV7

Zfp953, Zinc finger protein 953, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp953Q3UPV7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp953Q3UPV7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zfp953Q3UPV7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zfp953Q3UPV7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zfp953Q3UPV7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zfp953Q3UPV7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zfp953Q3UPV7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zfp953Q3UPV7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp953Q3UPV7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp953Q3UPV7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp953Q3UPV7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp953Q3UPV7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp953Q3UPV7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp953Q3UPV7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp953Q3UPV7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp953Q3UPV7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp953Q3UPV7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp953Q3UPV7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp953Q3UPV7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp953Q3UPV7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp953Q3UPV7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp953Q3UPV7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp953Q3UPV7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp953Q3UPV7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp953Q3UPV7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp953Q3UPV7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp953Q3UPV7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp953Q3UPV7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp953Q3UPV7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp953Q3UPV7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp953Q3UPV7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp953Q3UPV7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp953Q3UPV7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp953Q3UPV7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp953Q3UPV7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp953Q3UPV7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp953Q3UPV7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp953Q3UPV7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp953Q3UPV7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms