Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms