Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem253Q3UNB8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem253Q3UNB8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Tmem253Q3UNB8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem253Q3UNB8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tmem253Q3UNB8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tmem253Q3UNB8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tmem253Q3UNB8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tmem253Q3UNB8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tmem253Q3UNB8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Tmem253Q3UNB8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem253Q3UNB8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem253Q3UNB8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem253Q3UNB8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem253Q3UNB8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem253Q3UNB8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem253Q3UNB8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem253Q3UNB8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem253Q3UNB8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem253Q3UNB8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem253Q3UNB8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem253Q3UNB8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
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Tmem253Q3UNB8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tmem253Q3UNB8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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