Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULP7

Ctsll3, Cathepsin L-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctsll3Q3ULP7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms