Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mccc2Q3ULD5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms