Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcgf5Q3UK78 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pcgf5Q3UK78 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pcgf5Q3UK78 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pcgf5Q3UK78 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms