Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp19Q3UJD6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms