Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEN2

Fam35a, Protein FAM35A, mousemouse

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam35aQ3UEN2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam35aQ3UEN2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fam35aQ3UEN2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fam35aQ3UEN2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fam35aQ3UEN2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fam35aQ3UEN2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fam35aQ3UEN2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam35aQ3UEN2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam35aQ3UEN2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam35aQ3UEN2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam35aQ3UEN2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam35aQ3UEN2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam35aQ3UEN2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam35aQ3UEN2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam35aQ3UEN2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam35aQ3UEN2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam35aQ3UEN2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam35aQ3UEN2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam35aQ3UEN2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam35aQ3UEN2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam35aQ3UEN2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam35aQ3UEN2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam35aQ3UEN2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam35aQ3UEN2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms