Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

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Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Kdm4dQ3U2K5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Kdm4dQ3U2K5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Kdm4dQ3U2K5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Kdm4dQ3U2K5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdm4dQ3U2K5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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