Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms