Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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