Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQR0

Pgap2, Post-GPI attachment to proteins factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgap2Q3TQR0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pgap2Q3TQR0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms