Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms