Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIU4

Pde12, 2',5'-phosphodiesterase 12, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde12Q3TIU4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde12Q3TIU4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms