Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms