Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms