Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms