Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms