Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms