Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms