Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms