Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Nf1Q04690 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Nf1Q04690 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nf1Q04690 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nf1Q04690 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nf1Q04690 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nf1Q04690 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nf1Q04690 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nf1Q04690 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nf1Q04690 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nf1Q04690 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms