Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Kcnb1Q03717 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Kcnb1Q03717 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Kcnb1Q03717 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
Kcnb1Q03717 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Kcnb1Q03717 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kcnb1Q03717 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms