Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Runx1Q03347 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Runx1Q03347 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Runx1Q03347 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Runx1Q03347 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Runx1Q03347 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Runx1Q03347 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Runx1Q03347 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Runx1Q03347 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Runx1Q03347 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Runx1Q03347 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Runx1Q03347 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Runx1Q03347 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Runx1Q03347 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Runx1Q03347 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Runx1Q03347 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Runx1Q03347 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Runx1Q03347 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Runx1Q03347 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Runx1Q03347 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms