Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Epha4Q03137 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Epha4Q03137 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Epha4Q03137 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Epha4Q03137 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Epha4Q03137 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Epha4Q03137 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Epha4Q03137 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms