Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GscQ02591 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GscQ02591 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GscQ02591 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GscQ02591 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GscQ02591 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GscQ02591 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GscQ02591 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GscQ02591 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GscQ02591 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GscQ02591 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GscQ02591 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GscQ02591 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GscQ02591 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GscQ02591 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GscQ02591 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GscQ02591 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GscQ02591 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GscQ02591 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GscQ02591 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GscQ02591 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GscQ02591 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GscQ02591 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GscQ02591 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GscQ02591 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GscQ02591 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GscQ02591 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GscQ02591 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GscQ02591 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GscQ02591 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GscQ02591 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GscQ02591 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GscQ02591 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GscQ02591 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GscQ02591 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GscQ02591 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GscQ02591 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GscQ02591 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GscQ02591 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GscQ02591 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GscQ02591 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
GscQ02591 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GscQ02591 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GscQ02591 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GscQ02591 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GscQ02591 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GscQ02591 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GscQ02591 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GscQ02591 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GscQ02591 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GscQ02591 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GscQ02591 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GscQ02591 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GscQ02591 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GscQ02591 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GscQ02591 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GscQ02591 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GscQ02591 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GscQ02591 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GscQ02591 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GscQ02591 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GscQ02591 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GscQ02591 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GscQ02591 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GscQ02591 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GscQ02591 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GscQ02591 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GscQ02591 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GscQ02591 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GscQ02591 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GscQ02591 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GscQ02591 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GscQ02591 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GscQ02591 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GscQ02591 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GscQ02591 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GscQ02591 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GscQ02591 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GscQ02591 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GscQ02591 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GscQ02591 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GscQ02591 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GscQ02591 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GscQ02591 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GscQ02591 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GscQ02591 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GscQ02591 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GscQ02591 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GscQ02591 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GscQ02591 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GscQ02591 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GscQ02591 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GscQ02591 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GscQ02591 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GscQ02591 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GscQ02591 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GscQ02591 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GscQ02591 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GscQ02591 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GscQ02591 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms