Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PrkcqQ02111 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms