Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VcpQ01853 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VcpQ01853 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VcpQ01853 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VcpQ01853 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VcpQ01853 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VcpQ01853 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VcpQ01853 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms