Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms