Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SeleQ00690 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SeleQ00690 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SeleQ00690 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SeleQ00690 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SeleQ00690 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SeleQ00690 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SeleQ00690 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SeleQ00690 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SeleQ00690 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SeleQ00690 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms