Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GabpaQ00422 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GabpaQ00422 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms