Protein–RNA interactions for Protein: Q00286

Pou1f1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou1f1Q00286 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou1f1Q00286 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou1f1Q00286 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou1f1Q00286 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou1f1Q00286 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou1f1Q00286 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou1f1Q00286 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou1f1Q00286 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou1f1Q00286 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou1f1Q00286 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou1f1Q00286 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou1f1Q00286 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou1f1Q00286 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou1f1Q00286 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou1f1Q00286 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou1f1Q00286 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou1f1Q00286 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou1f1Q00286 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou1f1Q00286 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou1f1Q00286 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou1f1Q00286 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou1f1Q00286 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou1f1Q00286 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou1f1Q00286 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou1f1Q00286 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms