Protein–RNA interactions for Protein: P98063

Bmp1, Bone morphogenetic protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp1P98063 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bmp1P98063 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bmp1P98063 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bmp1P98063 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bmp1P98063 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bmp1P98063 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bmp1P98063 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Bmp1P98063 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bmp1P98063 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bmp1P98063 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Bmp1P98063 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bmp1P98063 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bmp1P98063 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bmp1P98063 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bmp1P98063 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bmp1P98063 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bmp1P98063 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bmp1P98063 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bmp1P98063 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bmp1P98063 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bmp1P98063 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bmp1P98063 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bmp1P98063 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bmp1P98063 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bmp1P98063 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bmp1P98063 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bmp1P98063 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bmp1P98063 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bmp1P98063 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bmp1P98063 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bmp1P98063 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bmp1P98063 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bmp1P98063 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bmp1P98063 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bmp1P98063 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bmp1P98063 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bmp1P98063 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bmp1P98063 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bmp1P98063 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms