Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfdP97946 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfdP97946 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfdP97946 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfdP97946 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfdP97946 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfdP97946 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfdP97946 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms