Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms