Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms