Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhodP97348 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhodP97348 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhodP97348 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhodP97348 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhodP97348 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhodP97348 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhodP97348 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RhodP97348 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RhodP97348 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RhodP97348 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhodP97348 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhodP97348 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhodP97348 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhodP97348 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhodP97348 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhodP97348 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhodP97348 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhodP97348 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhodP97348 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhodP97348 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhodP97348 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhodP97348 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhodP97348 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhodP97348 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhodP97348 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhodP97348 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhodP97348 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhodP97348 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhodP97348 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhodP97348 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhodP97348 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhodP97348 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhodP97348 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhodP97348 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhodP97348 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhodP97348 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhodP97348 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhodP97348 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhodP97348 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhodP97348 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhodP97348 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhodP97348 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhodP97348 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhodP97348 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhodP97348 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhodP97348 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhodP97348 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhodP97348 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhodP97348 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhodP97348 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhodP97348 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhodP97348 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhodP97348 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhodP97348 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhodP97348 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhodP97348 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhodP97348 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhodP97348 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhodP97348 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhodP97348 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhodP97348 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhodP97348 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhodP97348 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RhodP97348 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhodP97348 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhodP97348 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhodP97348 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhodP97348 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhodP97348 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhodP97348 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhodP97348 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhodP97348 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhodP97348 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhodP97348 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RhodP97348 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhodP97348 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhodP97348 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhodP97348 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhodP97348 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhodP97348 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RhodP97348 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RhodP97348 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhodP97348 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RhodP97348 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhodP97348 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhodP97348 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RhodP97348 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhodP97348 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhodP97348 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RhodP97348 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RhodP97348 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RhodP97348 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RhodP97348 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RhodP97348 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhodP97348 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhodP97348 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhodP97348 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhodP97348 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhodP97348 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms