Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms