Protein–RNA interactions for Protein: P84228

Hist1h3b, Histone H3.2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist1h3bP84228 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hist1h3bP84228 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms