Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms