Protein–RNA interactions for Protein: P83503

Nyx, Nyctalopin, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NyxP83503 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NyxP83503 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NyxP83503 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NyxP83503 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NyxP83503 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NyxP83503 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NyxP83503 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NyxP83503 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NyxP83503 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NyxP83503 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NyxP83503 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NyxP83503 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NyxP83503 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NyxP83503 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NyxP83503 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NyxP83503 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NyxP83503 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NyxP83503 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NyxP83503 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NyxP83503 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NyxP83503 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NyxP83503 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NyxP83503 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NyxP83503 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NyxP83503 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NyxP83503 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NyxP83503 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NyxP83503 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NyxP83503 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NyxP83503 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NyxP83503 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NyxP83503 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NyxP83503 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NyxP83503 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NyxP83503 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NyxP83503 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NyxP83503 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NyxP83503 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NyxP83503 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NyxP83503 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NyxP83503 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NyxP83503 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NyxP83503 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NyxP83503 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NyxP83503 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NyxP83503 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NyxP83503 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NyxP83503 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NyxP83503 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NyxP83503 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NyxP83503 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NyxP83503 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NyxP83503 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NyxP83503 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NyxP83503 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NyxP83503 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NyxP83503 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NyxP83503 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NyxP83503 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NyxP83503 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NyxP83503 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NyxP83503 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NyxP83503 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NyxP83503 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NyxP83503 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NyxP83503 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NyxP83503 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NyxP83503 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NyxP83503 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NyxP83503 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NyxP83503 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NyxP83503 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NyxP83503 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NyxP83503 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NyxP83503 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NyxP83503 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NyxP83503 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NyxP83503 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NyxP83503 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NyxP83503 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NyxP83503 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NyxP83503 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NyxP83503 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NyxP83503 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NyxP83503 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NyxP83503 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NyxP83503 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NyxP83503 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NyxP83503 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NyxP83503 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NyxP83503 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NyxP83503 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NyxP83503 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NyxP83503 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NyxP83503 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NyxP83503 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NyxP83503 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NyxP83503 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NyxP83503 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NyxP83503 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms