Protein–RNA interactions for Protein: P82350

Sgca, Alpha-sarcoglycan, mousemouse

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcaP82350 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgcaP82350 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcaP82350 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcaP82350 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcaP82350 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcaP82350 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcaP82350 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcaP82350 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcaP82350 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcaP82350 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcaP82350 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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