Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irf3P70671 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irf3P70671 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irf3P70671 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irf3P70671 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irf3P70671 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irf3P70671 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irf3P70671 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irf3P70671 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irf3P70671 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irf3P70671 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irf3P70671 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irf3P70671 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irf3P70671 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Irf3P70671 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irf3P70671 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irf3P70671 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irf3P70671 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irf3P70671 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irf3P70671 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irf3P70671 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irf3P70671 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irf3P70671 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Irf3P70671 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Irf3P70671 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irf3P70671 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irf3P70671 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irf3P70671 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irf3P70671 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irf3P70671 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf3P70671 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf3P70671 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf3P70671 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf3P70671 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf3P70671 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf3P70671 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf3P70671 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf3P70671 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf3P70671 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf3P70671 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf3P70671 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf3P70671 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf3P70671 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf3P70671 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf3P70671 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf3P70671 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf3P70671 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf3P70671 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf3P70671 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf3P70671 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf3P70671 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf3P70671 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irf3P70671 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irf3P70671 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irf3P70671 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irf3P70671 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irf3P70671 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irf3P70671 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irf3P70671 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irf3P70671 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf3P70671 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf3P70671 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irf3P70671 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms