Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Msx3P70354 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msx3P70354 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msx3P70354 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msx3P70354 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Msx3P70354 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Msx3P70354 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msx3P70354 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Msx3P70354 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Msx3P70354 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms