Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfi1P70338 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms