Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sycp3P70281 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms