Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms