Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms